Vila Flores está entre os municípios com boa gestão fiscal, segundo o Índice Firjan de Gestão Fiscal (IFGF) 2017 – ano de referência 2016. Dos municípios da região Nordeste do Estado, 35 estão com dificuldade de gestão, enquanto 28 alcançaram o conceito de boa gestão. Para definir o ranking são levados em conta cinco critérios: receita própria, gastos com pessoal, investimentos, liquidez e custo da dívida. Em cada um deles a nota vai de 0 a 1 e a média dessas notas resulta no IFGF.

Dos 4.544 municípios avaliados pela Firjan no país, Vila Flores ocupa a 617ª posição. Já no RS, das 485 cidades, o município ocupa a 103ª colocação. Um dos principais fatores que destaca o município neste índice é o critério de Gastos com Pessoal, que recebeu como nota 0,7353. Ele representa quanto os municípios gastam com pagamento de pessoal, em relação ao total da Receita Corrente Líquida. Neste item, Vila Flores ocupa a 334ª e 86ª posição, nacional e estadual, respectivamente. A cidade tem trabalhado na busca pela gestão fiscal eficiente, mantendo o controle das despesas com pessoal. As atividades são realizadas com uma equipe reduzida, mas que mantem a qualidade no serviço e atendimento, deixando recursos livres para serem investidos em outras áreas.